按照合同約定將員工工資直接支付給勞務派遣公
答：根據《企業會計準則第9號—職工薪酬》第二條規定，企業為獲得職工提供的服務或解除勞動關系而給予的各種形式的報酬或補償，屬于職工薪酬，應通過“應付職工薪酬”科目進行核算。
故，貴司支付給勞務派遣人員的工資部分，在會計上允許通過“應付職工薪酬”科目進行核算。
但是，根據《企業所得稅法實施條例》第三十四條規定，允許稅前扣除的工資薪金，是指支付給在本企業任職或者受雇的員工的所有現金形式或者非現金形式的勞動報酬。根據國家稅務總局公告2015年第34號第三條規定，企業接受外部勞務派遣用工支出，直接支付給勞務派遣公司的費用，應作為勞務費支出進行稅前扣除；直接支付給員工個人的費用，應作為工資薪金支出和職工福利費支出進行稅前扣除。
由于貴司是將勞務派遣人員的工資部分直接支付給勞務派遣公司的費用，不是直接支付給員工個人的，故，稅法上，需要作為勞務費支出在所得稅稅前扣除。
綜上，貴司直接支付給勞務派遣公司包含的員工工資部分，允許在會計上計入“應付職工薪酬”
科目核算，但是在企業所得稅扣除方面，需要作為勞務費支出扣除，不得以工資薪金支出稅前扣除。
特別提醒：實務中，一些企業為避免稅會差異的調整，在取得勞務派遣公司開具的發票時，將勞務費以及員工工資全部計入“勞務費”進行會計核算，并以勞務費支出在所得稅稅前扣除。
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相關規定：
《企業會計準則第9號——職工薪酬》
第二條職工薪酬，是指企業為獲得職工提供的服務或解除勞動關系而給予的各種形式的報酬或補償。職工薪酬包括短期薪酬、離職后福利、辭退福利和其他長期職工福利。企業提供給職工配偶、子女、受贍養人、已故員工遺屬及其他受益人等的福利，也屬于職工薪酬。
《企業所得稅法實施條例》
第三十四條企業發生的合理的工資薪金支出，準予扣除。
前款所稱工資薪金，是指企業每一納稅年度支付給在本企業任職或者受雇的員工的所有現金形式或者非現金形式的勞動報酬，包括基本工資、獎金、津貼、補貼、年終加薪、加班工資，以及與員工任職或者受雇有關的其他支出。
《國家稅務總局關于企業工資薪金和職工福利費等支出稅前扣除問題的公告》（國家稅務總局公告2015年第34號）
三、企業接受外部勞務派遣用工支出稅前扣除問題
企業接受外部勞務派遣用工所實際發生的費用，應分兩種情況按規定在稅前扣除：按照協議(合同)約定直接支付給勞務派遣公司的費用，應作為勞務費支出；直接支付給員工個人的費用，應作為工資薪金支出和職工福利費支出。其中屬于工資薪金支出的費用，準予計入企業工資薪金總額的基數，作為計算其他各項相關費用扣除的依據。
故，貴司支付給勞務派遣人員的工資部分，在會計上允許通過“應付職工薪酬”科目進行核算。
但是，根據《企業所得稅法實施條例》第三十四條規定，允許稅前扣除的工資薪金，是指支付給在本企業任職或者受雇的員工的所有現金形式或者非現金形式的勞動報酬。根據國家稅務總局公告2015年第34號第三條規定，企業接受外部勞務派遣用工支出，直接支付給勞務派遣公司的費用，應作為勞務費支出進行稅前扣除；直接支付給員工個人的費用，應作為工資薪金支出和職工福利費支出進行稅前扣除。
由于貴司是將勞務派遣人員的工資部分直接支付給勞務派遣公司的費用，不是直接支付給員工個人的，故，稅法上，需要作為勞務費支出在所得稅稅前扣除。
綜上，貴司直接支付給勞務派遣公司包含的員工工資部分，允許在會計上計入“應付職工薪酬”
科目核算，但是在企業所得稅扣除方面，需要作為勞務費支出扣除，不得以工資薪金支出稅前扣除。
特別提醒：實務中，一些企業為避免稅會差異的調整，在取得勞務派遣公司開具的發票時，將勞務費以及員工工資全部計入“勞務費”進行會計核算，并以勞務費支出在所得稅稅前扣除。
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相關規定：
《企業會計準則第9號——職工薪酬》
第二條職工薪酬，是指企業為獲得職工提供的服務或解除勞動關系而給予的各種形式的報酬或補償。職工薪酬包括短期薪酬、離職后福利、辭退福利和其他長期職工福利。企業提供給職工配偶、子女、受贍養人、已故員工遺屬及其他受益人等的福利，也屬于職工薪酬。
《企業所得稅法實施條例》
第三十四條企業發生的合理的工資薪金支出，準予扣除。
前款所稱工資薪金，是指企業每一納稅年度支付給在本企業任職或者受雇的員工的所有現金形式或者非現金形式的勞動報酬，包括基本工資、獎金、津貼、補貼、年終加薪、加班工資，以及與員工任職或者受雇有關的其他支出。
《國家稅務總局關于企業工資薪金和職工福利費等支出稅前扣除問題的公告》（國家稅務總局公告2015年第34號）
三、企業接受外部勞務派遣用工支出稅前扣除問題
企業接受外部勞務派遣用工所實際發生的費用，應分兩種情況按規定在稅前扣除：按照協議(合同)約定直接支付給勞務派遣公司的費用，應作為勞務費支出；直接支付給員工個人的費用，應作為工資薪金支出和職工福利費支出。其中屬于工資薪金支出的費用，準予計入企業工資薪金總額的基數，作為計算其他各項相關費用扣除的依據。